Route
Accès rapide depuis les grands axes nantais. Parkings publics à proximité immédiate du musée, notamment dans le secteur Cathédrale et centre-ville.

Train
Le musée se situe à quelques minutes de la gare SNCF de Nantes, facilitant l'organisation de séminaires avec des participants venant de Paris ou des grandes métropoles françaises.

Transports en commun
Desservi par le tramway (lignes 1 et 2), le Busway 4 ainsi que plusieurs lignes de bus (C1, C6, 11 et 12).